US2018094047A1PendingUtilityA1

Anti-pre-s1 hbv antibodies

Assignee: HUAHUI HEALTH LTDPriority: May 22, 2015Filed: May 23, 2016Published: Apr 5, 2018
Est. expiryMay 22, 2035(~8.8 yrs left)· nominal 20-yr term from priority
C07K 2317/92C07K 2317/55C07K 2317/732C07K 16/082C07K 2317/622C07K 2317/56C07K 2317/76C07K 2317/34A61P 31/20C07K 2317/33C07K 2317/21A61K 2039/505C07K 2317/565Y02A50/30
54
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Claims

Abstract

Provided are human antibodies that specifically bind to HBV Pre-S1 domain ligand and inhibit HBV or HDV infection, antibodies binding to a set of amino acid residues that are critical for viral receptor engagement, and uses of these antibodies to prevent, or treat or diagnose HBV or HDV infection.

Claims

exact text as granted — not AI-modified
What is claimed is: 
     
         1 . An antibody antigen binding domain which specifically binds HBV Pre-S1, and comprises complementarity determining region (CDR) 1, CDR2 and CDR3, in a combination selected from (a)-(r) as follows, wherein the antibody (Ab), heavy chain (HC) or light chain (LC) and CDR nomenclature system (Kabat, IMGT or composite) from which the CDR combinations derive are shown in the first column, and residues in bold text are Kabat system, and residues underlined are IMGT system: 
       
         
           
                 
               
                     
                 
                   HCDRs of unique HBV Pre-S1 specific antibodies 
                 
                 
                 
                 
                 
               
                   MAbs 
                   CDR1 
                   CDR2 
                   CDR3 
                 
                     
                 
                   m36-HC 
                   
                     GFTFD DYA   
                     MH 
                   
                   
                     G 
                     
                       ISWNSGSI 
                     
                     GYADSVKG 
                   
                   
                     AK TSYGGAFDI   
                   
                 
                     
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                   m36-LC 
                   
                     SGN 
                     
                       TSNIGSYY 
                     
                     AY 
                   
                   
                     
                       DNN 
                     
                     QRPS 
                   
                   
                     
                       ATWDDSLNGPV 
                     
                   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 62 
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                   C: SEQ ID NO: 64 
                 
                     
                 
                   71-HC 
                   
                     GYTT GYY   
                     IH 
                   
                   
                     
                       RINPNSGGTN 
                     
                   
                   AR EGRGGMDV   
                 
                     
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                   71-LC 
                   
                       RSSQSLLHSNGY NY 
                   
                   
                     
                       LGSNRAS 
                     
                   
                   
                     
                       MQGLQPPIT 
                     
                   
                 
                     
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                   76-HC 
                   
                     GFTFS SYA   
                     MH 
                   
                   
                     V 
                     
                       ISYDGSNK 
                     
                     YYADSVKG 
                   
                   
                     AS GAFDI   
                   
                 
                     
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                   76-LC 
                   
                     RSS 
                     
                       HSLVYSDGNTY 
                     
                     LS 
                   
                   
                     
                       KVS 
                     
                     NRDF 
                   
                   
                     
                       MQGTHWPGT 
                     
                   
                 
                     
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                   T47-HC 
                   
                     GDSVS SNSVA   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSKWYN 
                     
                     DYAVSVKS 
                   
                   
                     AR ADGSRGGGYDQ   
                   
                 
                     
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                     KSS 
                     
                       QSILYRSNNKNY 
                     
                     LA 
                   
                   
                     
                       WAS 
                     
                     TRES 
                   
                   
                     
                       QQYYTTPQ 
                     
                     T 
                   
                 
                     
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                   m1Q-HC 
                   
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                     MH 
                   
                   
                     V 
                     
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                     R 
                     
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                     SGS 
                     
                       SSNIGSYY 
                     
                     VYWY 
                   
                   
                     
                       GNN 
                     
                     QRPS 
                   
                   
                     
                       QSYDSSLSGVI 
                     
                   
                 
                     
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                     V 
                     
                       ISYDGSNK 
                     
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                       QSVSSN 
                     
                     LA 
                   
                   
                     
                       GAS 
                     
                     TRAT 
                   
                   
                     
                       QQYNNWPPIT 
                     
                   
                 
                     
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                   C: SEQ ID NO: 100 
                 
                     
                 
             
                
                
               
            
             
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
               
            
           
         
       
       
         
           
                 
               
                     
                 
                   HCDRs of antibodies derived from 2H5 VH-chain shuffled libraries 
                 
                 
                 
                 
                 
               
                   MAbs 
                   HCDR1 
                   HCDR2 
                   HCDR3 
                 
                     
                 
                   #4 VH 
                   
                     GDSVS SKSVT   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSKWFN 
                     
                     DYAVS 
                   
                   
                     AR AKMGGMDV   
                   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 101,  
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                   C: SEQ ID NO: 101 
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                   C: SEQ ID NO: 103 
                 
                     
                 
                   #31 VH 
                   
                     GDSVS SNSAA   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSKWYN 
                     
                     DYAVS 
                   
                   
                     TR QSWHGMEV   
                   
                 
                     
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                   #32 VH 
                   
                     GDSVS SNSAA   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSKWYN 
                     
                     DYAVS 
                   
                   
                     AR SIATGTDY   
                   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 107,  
                   K: SEQ ID NO: 108 
                   K: SEQ ID NO: 109,  
                 
                     
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                   I: SEQ ID NO: 109 
                 
                     
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                   C: SEQ ID NO: 108 
                   C: SEQ ID NO: 109 
                 
                     
                 
                   #69 VH 
                   
                     GDSVS SSRAT   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSKWFN 
                     
                     DYAVS 
                   
                   
                     AR AKMGGMDV   
                   
                 
                     
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                   A14 VH 
                   
                     GDSVS SNSAA   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSKWYN 
                     
                     DYAVS 
                   
                   
                     AR GTRWGMDV   
                   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 113,  
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                   K: SEQ ID NO: 115,  
                 
                     
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                   I: SEQ ID NO: 114,  
                   I: SEQ ID NO: 115 
                 
                     
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                   C: SEQ ID NO: 113 
                   C: SEQ ID NO: 114 
                   C: SEQ ID NO: 115 
                 
                     
                 
                   A21 VH 
                   
                     GDSVS SNSAA   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSKWYN 
                     
                     DYAVS 
                   
                   
                     AR AKVYGVDV   
                   
                 
                     
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                   K: SEQ ID NO: 118,  
                 
                     
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                   C: SEQ ID NO: 117 
                   C: SEQ ID NO: 118 
                 
                     
                 
                   B103 VH 
                   
                     GDSVS SKSAT   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSRWFN 
                     
                     DYAVS 
                   
                   
                     AR GNMGAMDV   
                   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 119,  
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                   C: SEQ ID NO: 121 
                 
                     
                 
                   B129 VH 
                   
                     GDRVS SNRAA   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSQWYN 
                     
                     DYAVS 
                   
                     AR GTAMG   - DA   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 122,  
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                   B139 VH 
                   
                     GDSVS SNSAA   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSKWYN 
                     
                     DYAVS 
                   
                   
                     AR QASNGFDI   
                   
                 
                     
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                   K: SEQ ID NO: 127,  
                 
                     
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                   B172 VH 
                   
                     GDSVS SNSAA   
                     WN 
                   
                   
                     R 
                     
                       TYYRSKWYN 
                     
                     DYAVS 
                   
                   
                     AR QGTTGFDY   
                   
                 
                     
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                   C: SEQ ID NO: 129 
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                   HCDRs of antibodies derived from A14 VL-chain shuffled libraries 
                 
                 
                 
                 
                 
               
                   MAbs 
                   LCDR1 
                   HCDR2 
                   HCDR3 
                 
                     
                 
                   #8 VL 
                   
                     SGS 
                     
                       SSNIGNYY 
                     
                     VSWY 
                   
                   
                     
                       DNA 
                     
                     KRPS 
                   
                   
                     
                       QSYDNSLSGLV 
                     
                   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 131 
                   K: SEQ ID NO: 132 
                   K: SEQ ID NO: 133 
                 
                     
                   I: SEQ ID NO: 131,  
                   I: SEQ ID NO: 132,  
                   I: SEQ ID NO: 133 
                 
                     
                   res. 4-11 
                   res. 1-3 
                     
                 
                     
                   C: SEQ ID NO: 131 
                   C: SEQ ID NO: 132 
                   C: SEQ ID NO: 133 
                 
                     
                 
                   #20 VL 
                   
                     SGT 
                     
                       SSNIGSKY 
                     
                     VYWY 
                   
                   
                     
                       TND 
                     
                     QRPS 
                   
                   
                     
                       QSYDSSLRAVV 
                     
                   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 134 
                   K: SEQ ID NO: 135 
                   K: SEQ ID NO: 136 
                 
                     
                   I: SEQ ID NO: 134,  
                   I: SEQ ID NO: 135,  
                   I: SEQ ID NO: 136 
                 
                     
                   res. 4-11 
                   res. 1-3 
                     
                 
                     
                   C: SEQ ID NO: 134 
                   C: SEQ ID NO: 135 
                   C: SEQ ID NO: 136 
                 
                     
                 
                   #20-m1 VL 
                   
                     SGT 
                     
                       SSNIGSFY 
                     
                     VYWY 
                   
                   
                     
                       TND 
                     
                     QRPS 
                   
                   
                     
                       QSYDSSLRAVV 
                     
                   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 137 
                   K: SEQ ID NO: 138 
                   K: SEQ ID NO: 139 
                 
                     
                   I: SEQ ID NO: 137,  
                   I: SEQ ID NO: 138,  
                   I: SEQ ID NO: 139 
                 
                     
                   res. 4-11 
                   res. 1-3 
                     
                 
                     
                   C: SEQ ID NO: 137 
                   C: SEQ ID NO: 138 
                   C: SEQ ID NO: 139 
                 
                     
                 
                   #20-m2 VL 
                   
                     SGT 
                     
                       SSNIGSFY 
                     
                     VYWY 
                   
                   
                     
                       TND 
                     
                     QRPS 
                   
                   
                     
                       QSYDSSLRAVV 
                     
                   
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 140 
                   K: SEQ ID NO: 141 
                   K: SEQ ID NO: 142 
                 
                     
                   I: SEQ ID NO: 140,  
                   I: SEQ ID NO: 141,  
                   I: SEQ ID NO: 142 
                 
                     
                   res. 4-11 
                   res. 1-3 
                     
                 
                     
                   C: SEQ ID NO: 140 
                   C: SEQ ID NO: 141 
                   C: SEQ ID NO: 142 
                 
                     
                 
                   #20-m3 VL 
                   
                     SGT 
                     
                       SSNIGSYY 
                     
                     VYWY 
                   
                   
                     
                       TND 
                     
                     QRPS 
                   
                       QSYDSSLRAVV   . 
                 
                     
                   K: SEQ ID NO: 143 
                   K: SEQ ID NO: 144 
                   K: SEQ ID NO: 145 
                 
                     
                   I: SEQ ID NO: 143,  
                   I: SEQ ID NO: 144,  
                   I: SEQ ID NO: 145 
                 
                     
                   res. 4-11 
                   res. 1-3 
                     
                 
                     
                   C: SEQ ID NO: 143 
                   C: SEQ ID NO: 144 
                   C: SEQ ID NO: 145. 
                 
                     
                 
             
                
                
               
            
             
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
                
               
            
           
         
       
     
     
         2 . An antibody antigen binding domain according to  claim 1  comprising a heavy chain variable region (Vh) comprising a CDR1, CDR2 and CDR3 combination and a light chain variable region (Vl) comprising a CDR1, CDR2 and CDR3 combination, selected from:
 m36, 71, 76, T47, m1Q, 2H5, m150; and 
 4, 31, 32, 69, A14, A21, B103, B129, B139, B172; and 
 8, 20, 20-m1, 20-m2, 20-m3. 
 
     
     
         3 . An antibody antigen binding domain according to  claim 1  comprising a heavy chain variable region (Vh) or a light chain variable region (VD, selected from:
 m36, 71, 76, T47, m1Q, 2H5, m150; and 
 4, 31, 32, 69, A14, A21, B103, B129, B139, B172; and 
 8, 20, 20-m1, 20-m2, 20-m3. 
 
     
     
         4 . An antibody antigen binding domain according to  claim 1  comprising a heavy chain variable region (Vh) and a light chain variable region (Vl), selected from
 m36, 71, 76, T47, m1Q, 2H5, m150; and 
 4, 31, 32, 69, A14, A21, B103, B129, B139, B172; and 
 8, 20, 20-m1, 20-m2, 20-m3. 
 
     
     
         5 . An antibody antigen binding domain according to any of  claims 1 - 4  which specifically binds aa11-28 or aa19-25 of pre-S1. 
     
     
         6 . A monoclonal IgG antibody comprising an antibody antigen binding domain according to any of  claims 1 - 5 . 
     
     
         7 . A method of using an antibody antigen binding domain according to any of  claims 1 - 5  to treat HBV or HDV infection or to induce antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC), comprising the step of administering the domain to a person determined to have HBV or HDV infection, to have been exposed to HBV or HDV, to be at high risk for HBV or HDV exposure or infection, to be in need of Pre-S1 domain antagonism, or to be otherwise in need thereof. 
     
     
         9 . An expression vector encoding an antibody antigen binding domain according to any of  claims 1 - 5 . 
     
     
         10 . A cultured cell expressing an antibody antigen binding domain according to any of  claims 1 - 5 .

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